يمكن استخدام مقياس طيف الكتلة في سلسلة الببتيدات

إن استخدام القصف الذري السريع (”Fast atom bombardment "FAB) المقترن مع قياس الطيف الكتلوي (”Mass spectrometry “MS) في جهازين لقياس الطيف الكتلوي (Mass spectrometer) مرتبطين معاًيقدم لنا طريقة بديلة لسلسة الببتيدات التي لا يتجاوز طولها 25 ثمالة؛ حيث أن القصف السريع بذرات الأرجون أو الزينون للببتيد المنحل في الجليسرول يشكل أيوناً ببتيديا مشحوناً بشحنة إيجابية. ويعمل مقياس الطيف الكتلوي الأول على عزل أيون الببتيد عن الأيونات المرافقة، ثم ينقلها إلى خلية يتم فيها تشكيل مادة غروانية من الببتيد وذرات الهليوم. وتبعا للطاقة الممتصة، يتجزأ أيون الببتيد من نهايتيه لتتشكل عدة أيونات ذات قياسات أصغر. ويجري تحديد الكتل الجزيئية لهذه الشدف الأيونية بمقياس الطيف الكتلوي الثاني.

وتسمح مقارنة الأيونات متزايدة الكتلة بالتدريج بالتعرف على جميع شدف الأحماض الأمينية وبتحديد تسلسل الببتيد بأكمله. وتعد تقنية FAB-MS المسيرة بالحاسوب نظاماً سريعاً جداً، ولا يحتاج لببتيدات عالية النقاوة، وهو يكشف الثمالات المحورة بعد الترجمة. وبعكس طريقة إدمان، فإنه يستطيع أن يسلسل الببتيدات ذات النهايات الأمينية المحصورة (Blacked) المؤسيلة (Acylated) (مثلاً). وبالمقارنة مع مسلسلات «إدمان» المتطورة، فإن أنظمة FAB-MS أكثر كلفة وأقل حساسية، وتبقى سرعتها الكبيرة هى مزيتها الأساسية.