تصنيف البكتريا الممرضة للنبات

Taxonomy of Plant Pathogenic Bacteria

في تصنيف البكتريا تستخدم الصفات المظهرية والصبغية وبدرجة أكبر تركيب الجدار والصفات الفسلجية والكيموحيوية كالقدرة على استغلال السكريات المختلفة وإنتاج الحوامض أو الغازات والفعاليات الإنزيمية. لكن الصفات الجزيئية والوراثة الجزيئية أخذت المكانة الأولى في السنوات الأخيرة لما توفره من معطيات رصينة ومحددة وتكشف هوية البكتريا والعلاقات التطورية لها. إن هذه الدراسات تستخدم التشخيص الجزيئي لوحدات S ribosomal RNA16 حيث أنها تشفر بواسطة جينات محافظة جدا (واطنة التغاير أو ثابتة مما يؤهلها لأن تعكس الصفات الأكثر ثباتا للأنواع. كذلك مقارنة تتابعات القواعد النتروجينية للـ DNA والتي تختلف عن تحليلات RNA الرايبوسي إن الدراسات الجزيئية غيرت من التقسيمات التقليدية في كافة مجاميع الأحياء ومنها البكتريا وهي تعطي الصورة الأكثر صدقية عن علاقات القربى بين الأنواع وتمكن من بناء تقسيم يعتمد على علاقاتها التطورية. وبناء على ما تقدم مر تقسيم البكتريا وغيرها من الأحياء بمراحل مختلفة تتميز بتحسين القدرة على التشخيص والتفريق وبالتالي ظهرت وتظهر باستمرار تعديلات وتغيرات على التقسيمات السائدة واسماء الأنواع والمراتب التصنيفية المختلفة. وهكذا نصادف الكثير من الحالات التي تشير إلى أسماء مرادفة أي الاسم أو الأسماء التي عرف بها النوع أو الجنس الخ. سابقا في الكثير من الحالات يصعب تفريق الأنواع الممرضة على عوائل معينة مما يستدعي استخدام تسميات "ضرب إمراضي Pathovar" أو "طراز بيولوجي Biotype" أو نوع البلازميد كما في حالة البكتريا Agrobacterium tumefaciens تلحق بالاسم العلمي وهي ليست جزءا منه.

ثمة 1600 نوعا من البكتريا معظمها رمية، عدد منها ممرض للإنسان والحيوان وحوالي 100 نوعا ممرضة للنبات (2005,Agrios). عدد أنواع أو تحت أنواع أو ضروب البكتريا الممرضة للنبات الأكثر انتشارا في الولايات المتحدة يبلغ (University of Georgia, 2010b) 129

معظم البكتريا الممرضة للنبات تكون موجبة لصبغة كرام وتتبع شعبة Actinobacteria أو سالبة لصبغة كرام في شعبة Proteobacteria.

فيما يلي تقسيم البكتريا الممرضة للنبات:

* مملكة بدائيات النواة Kingdom: Procaryotae

البكتريا تمتلك جدار وغشاء خلية ولا تمتلك غلاف نووي.

* قسم Gracilicutis - البكتريا السالبة لصبغة كرام.

* صنف Proteabacteria - بكتريا معظمها وحيدة الخلية.

* عائلة Enterobacteriaceae

- جنس Erwinia تسبب امراض اللفحة النارية على التفاح والكمثرى ومرض الذبول الستيوارتي على الذرة وأمراض التعفن الطري على الخضروات اللحمية.

- جنس Pantoea تسبب مرض الذبول في الذرة.

- جنس Serratia البكتريا S. marcescens تنمو في نسيج اللحاء وتسبب مرض اصفرار الحوالق في القرعيات.

- جنس Sphingomonas تسبب مرض التبقع البني في ثمار البطيخ الإسباني.

* عائلة Pseudomonadaceae

- جنس Acidovorax يسبب مرض تبقع الأوراق في الذرة والسحالب (Orchids) والرقي (Watermelon).

- جنس Pseudomonas يسبب العديد من أمراض تبقع الأوراق واللفحات وامراض الذبول الوعائي والتعفن الطري والتسوس والأورام.

- جنس Ralstonia يسبب أمراض الذبول في نباتات العائلة الباذنجانية.

- جنس Rhizobacter يسبب التدرن البكتيري في الجزر.

- جنس Rhizomonas يسبب التعفن الفليني في الخس.

- جنس Xanthomonas يسبب العديد من امراض تبقع الأوراق والثمار واللفحات على العديد من النباتات الحولية والمعمرة وأمراض الذبول والتسوس.

- جنس Xylophilus يسبب أمراض نخر وتسوس العنب.

* عائلة Rhizobiaceae

- جنس Agrobacterium يسبب أمراض التدرن التاجي.

- جنس Rhizobium بسبب تكوين العقد الجذرية المثبتة للنتروجين في النباتات البقولية.

* عائلة غير مسماة بعد

- جنس Xylella يتواجد في أنسجة الخشب ويسبب مرض سفعة الأوراق والموت التراجعي على الأشجار والأعناب.

- Candidatus liberobacter تتواجد في أنسجة اللحاء وتسبب مرض اخضرار الحمضيات.

- بكتريا غير مسماة تتواجد في قنواة الحليب النباتي وتسبب تعتقد قمة البابايا.

* قسم Firmicutes - البكتريا الموجبة لصبغة كرام.

* صنف Firmibacteria - معظمها بكتريا وحيدة الخلية.

- جنس Bacillus يسبب أمراض تعفن الدرنات والبذور والبادرات ومرض التخطيط الأبيض في القمح.

جنس Clostridium يسبب تعفن الدرنات والأوراق المخزونة ومرض تعفن الخشب الرطب في الحور والدردار.

* صنف Thallobackria - البكتريا المتفرعة

- جنس Arthrobacter يسبب اللفحة البكتيرية على نبات البهشية (Holly) ويعتقد انه مسبب مرض التعقد البكتيري على تنوب دوغلاس.

- جنس Clavibacter يسبب الذبول لبكتيري في الجت والبطاطا والطماطة.

- جنس Curtobacterium يسبب مرض الذبول في الفاصوليا وغيرها.

- جنس Leifsonia يسبب مرض تقزم الخلفة في قصب السكر.

- جنس Rhodococc يسبب مرض شمعلة البزاليا الحلوة.

- جنس Streptomyces يسبب مرض الجرب العادي في البطاطا.

Mollicutes البكتريا الشبيهة بالمايكوبلازما - تمتلك غشاء الخلية تفتقد لجدار الخلية (2006 ,Cooper).

* قسم Mollicues

* صنف Mollicutes

* عائلة Spiroplasmataceae

- جنس Spiroplasma يسبب امراض تقزم الذرة ومرض العناد في الحمضيات.

* عائلة أو عوائل غير مسماة

- جنس غير مشخص يسمى فايتوبلازما (Phytoplasma) (سابقا يسمى أحياء شبيهة بالمايكوبلازما MLO يسبب عدد كبير من امراض الاصفرار وفرط النمو والتدهور في الأشجار وبعض النباتات الحولية (Agrios,1997).