يعتبر من الإنزيمات متعددة السلسلة الببتيدية المكون من وحدتين فرعيتين ذو وظائف مختلفة، كل وحدة فرعية ذو وزن جزيئي 29000 من نوع ألفا ووحدة فرعية من نوع 2 ذو وزن جزيئي والذي تتحلل بوجود 4 مول يوريا لتعطي وحدتين فرعيتين من نوع بيتا ولكل واحدة منها موقع لربط المرافق الإنزيمي بيريدوكسال فوسفيت حيث تتمكن الوحدتين الفرعيتين من نوع ألفا لإنجاز التفاعل التالي:

Indole-3-glycerol phosphate ↔ indole + glyceradehyde 

بينما تتمكن الوحدة الفرعية من النوع a₂ من إنجاز التفاعل الآتي:

Indole + L-Serine ↔ L-tryptophan 

يتضح من مما سبق بان الوحدات الفرعية المختلفة لإنزيم تخليق التربتوفين لها القدرة في إنجاز نصفي التفاعل الكلي كلا على حدة إلا أن سرعة التفاعل المنجز عندما يكون الإنزيم الجميع وحداته الفرعية كوحدة كاملة غير مجزأة إلى أنصاف فالمركب الوسطي (الاندول) بير من الموقع الفعال للوحدة الفرعية من نوع ألفا إلى الموقع الفعال للوحدة الفرعية من نوع بيتا ويعتقد بان هذه المواقع تكون قريبة من بعضها البعض بحيث تساعد على زيادة الكفاءة الكلية للكبد.