أن الأحماض الأمينية لا تمتص الضوء المرئي Visible light لذلك فهي عديمـــة اللـــون الأحماض الأمينية الأروماتية التربتوفان والتايروسين والفينايل (ألانين الأشعة فوق البنفسجيــة (الشكل 11-5) عند طول موجي بين 260 - 280 نانوميتر ويعود معظم امتصاص البروتينات في الأشعة فوق البنفسجية الى وجود التربتوفان كونه يحتوي على حلقة الأندول مرتبطة بمجموعة المثيلين ( Methylene (-CH₂   وبالتالي زيادة إلكترونات باي (π) والتي تمتص بقوة الأشعة فوق البنفسجية وتكون لها معامل حيود عالي (معامل الامتصاص المولاري ε ) (الذي يعطي مؤشر على قابلية المركب لامتصاص الضوء واستناداً الى قانون بیرلامبرتcl ε A=  عند قيمة  M^-1 cm^-1  6400 وله طول موجي لأعلى امتصاص عند 280 نانوميتر ويأتي بعده الحامض الأميني التايروسين له معامل امتصاص مولاري عند قيمة M^-1  cm^-1  1400 وأعلى امتصاص عند طول موجي 274 نانوميتر ثم الفينايل ألانين الذي لديه طول موجي لأعلى امتصاص عند 256 نانوميتر ومعامل امتصاص مولاري عندM^-1  cm^-1200