حامض المعدة : تعتبر الوظيفة رئيسية لحمض الهيدروكلوريك هى المساعدة في هضم البروتينات، حيث يقوم HCl بذلك عن طريق الحفاظ على مستوى pH الأمثل في المعدة.
وتختلف مستويات الحموضة في المعدة مابين 1-2 حتى 4-5، و قد يؤدي تناول وجبة غنية بالبروتين إلى انخفاض مستويات الأس الهيدروجيني في المعدة إلى أقل من 1. ويكون حمض الهيدروكلوريك بيئة حمضية مثالية لتحويل البيبسين، وهو إنزيم معدٍ غير نشط، إلى إنزيم البيبسين النشط، و البيبسين هو إنزيم قوي يستخدم في عملية هضم البروتينات. مخاطر التعرض له خارجيا تكون خطرة جدا